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《图集》被称为史学界的两大基础工程之一(另一工程为二十四史的点校),全书共八册、二十个图组、三百零四幅地图,收录了清代以前全部可考的县级和县级以上的行政单位、主要居民点、部族名以及河流、湖泊、山脉、山峰、运河、长城、关隘、海洋、岛屿等约七万余个地名。
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他也注重野外实地考察,在编绘《图集》和考察长江水系和黄河古道时,他的足迹遍布天山南北、中原大地,对于经过的一千五百多个县,他能一一道明它们地理位置和隶属关系。
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李日华也擅绘画,所作山水、墨竹,格调高雅。
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万历三十二年(1604),李日华因母亲去世,按制回乡守丧,并因要终养老父,上疏乞请归田获准,开始了长达二十余年的乡居休闲生活。
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天启四年(1624),李日华受嘉兴知县汤齐之聘,参与纂修《嘉兴县志》(即明崇祯《嘉兴县志》)。
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他熟读大量古代典籍,因为经常查阅《汉书·地理志》,几乎将该书全部翻烂,《水经注图》也被翻得中缝破裂。